Universidad de Chile
Programa Conjunto
DOCTORADO EN NUTRICIÓN Y ALIMENTOS
CURSO ELECTIVO - SEGUNDO SEMESTRE 2007
“EPIDEMIOLOGÍA GENÉTICA DE ENFERMEDADES CRÓNICAS RELACIONADAS CON LA
NUTRICIÓN”
Coordinador Titular: José Luis Santos, PhD. Biología, MSc. Bioestadística, MSc
Epidemiología Genética. Profesor Asociado. INTA -
Universidad de Chile. (jsantos@inta.cl)
Horario: Miércoles 9:00 – 13:00
Período: 17 de octubre a 5 de diciembre de 2007
Lugar: INTA
Número de horas presenciales: 36
Créditos: 6
Objetivo general
El objetivo de este curso es proporcionar conocimientos sobre los principios y métodos usados en el diseño, conducción y análisis de estudios en epidemiología genética aplicados a enfermedades relacionadas con la nutrición.
Nos centraremos en la metodología de estudio que nos permitirá responder a preguntas clásicas de la epidemiología genética aplicadas a enfermedades con base nutricional: 1) ?Existe agregación familiar de ciertos rasgos o enfermedades?; 2) ?Existe un componente genético dentro de esa agregación familiar o la agregación se debe a factores ambientales compartidos? 3) ?Es posible localizar regiones cromosómicas que contienen genes responsables de enfermedades por la observación de marcadores genéticos en familias?; 4) ?Es posible cuantificar el riesgo absoluto y relativo de enfermar asociado a variantes genéticas de susceptibilidad? 5) ?Es posible establecer algún tipo de interacción epidemiológica genotipo-nutrición en el desarrollo de enfermedades crónicas relacionadas con la nutrición? Se mostrarán estudios en patologías como la obesidad, diabetes (tipo 1 y tipo 2), anorexia, síndrome de ovario poliquístico o alteraciones de la conducta alimentaria entre otros.
Programa
Clase 1. Enfermedades relacionadas con la nutrición: Estudios de agregación familiar y
estudios de mellizos. Miércoles, 17 de octubre (4 horas)
; Epidemiología genética: concepto y definiciones
; Genética y nutrición: enfermedades con base genética relacionadas con la nutrición
; Preguntas de investigación abordables en estudios de epidemiología genética de
enfermedades relacionadas con la nutrición
; Simbología genética de estudios familiares: modelos mendelianos simples y modelos
genéticos aplicables a enfermedades crónicas
; Estudios de agregación familiar en enfermedades relacionadas con la nutrición. Riesgo de
recurrencia en familiares. Estadística lambda-r
; Construcción de índices de historia familiar y su uso en estudios epidemiológicos de
enfermedades crónicas relacionadas con la nutrición
; Estudios de mellizos (gemelos) monozigóticos y dizigóticos. Evaluación de la
contribución de la genética en la agregación familiar en rasgos cualitativos (diabetes tipo
1) y en rasgos cuantitativos (adiposidad, índice de masa corporal, puntajes de
inclinaciones hacia la alimentación)
; Estudios de gemelos monozigóticos que crecieron en ambientes separados. Concepto
de heredabilidad estimado desde los estudios de mellizos
; Otros estudios de gemelos: Estudios de intervención en gemelos monozigóticos. Estudios
de gemelos fenotípicamente discordantes
Clase 2. Marcadores genéticos en familias y poblaciones. Miércoles, 24 de octubre
(4 horas)
; Marcadores genéticos en familias y en poblaciones. Tipos de marcadores genéticos más
usados en estudios epidemiológicos. Nomenclatura y notación de polimorfismos
genéticos
; Fracción de recombinación como medida de distancia genética. Mapas genéticos.
Concepto de ligamiento
; Descripción de frecuencias alélicas y genotípicas en poblaciones. Equilibrio de Hardy-
Weinberg
; Análisis de haplotipos en poblaciones. Concepto de desequilibrio de ligamiento. Medidas
de desequilibrio de ligamiento
Clase 3. Clase práctica: Determinación de genotipos en marcadores genéticos: análisis
“in-silico” y análisis de laboratorio. Miércoles, 31 de octubre (8 horas – todo el
día)
Clase 4. Estudios de ligamiento en enfermedades relacionadas con la nutrición.
Miércoles, 7 de noviembre (4 horas)
; Mapeo genético de enfermedades por estudios de ligamiento: concepto, definiciones
básicas y objetivos
; Estudios de ligamiento en enfermedades mendelianas. Ligamiento paramétrico. Cálculo
de LOD score en genealogías multigeneracionales. Aplicación en enfermedades
mendelianas con referencia a síndromes relacionados con la obesidad
; Estudios de ligamiento en enfermedades complejas de carácter dicotómico: Ligamiento
de tipo no paramétrico. Estudios familiares de pares de hermanos afectados. Aplicación
en diabetes tipo 1
; Estudios de ligamiento en rasgos continuos: ejemplos en estudios sobre la ganancia de
peso y sobre rasgos relacionados con el comportamiento alimentario y el equilibro
energético
Clase 5. Estudios de asociación en epidemiología genética (I). Miércoles, 14 de
noviembre (4 horas)
; Estudios de asociación en epidemiología genética: usos, aplicaciones y diseños básicos ; Diseños de estudio de asociación genotipo-enfermedad
; Tipos de asociación: asociación causal (directa), asociación indirecta (por desequilibrio
de ligamiento), asociación confundida, asociación sesgada, asociación azarosa. Sesgos
en estudios de asociación en epidemiología genética
; Concepto de asociación por desequilibrio de ligamiento (asociación indirecta). Mapeo
genético de enfermedades por desequilibrio de ligamiento. Mapeo genético por
desequilibrio de ligamiento en enfermedades mendelianas y en enfermedades de
etiología compleja. Estudios de mapeo genético por ligamiento versus estudios de
mapeo genético por desequilibro de ligamiento
; Estrategias de mapeo genético de enfermedades complejas: estudios de segmentos
compartidos, estudios de casos y controles, estudios de asociación con base familiar
Clase 6. Estudios de asociación en epidemiología genética (II). Miércoles, 21 de
noviembre (4 horas)
; Concepto de asociación causal: modelos de Rothman.
; Diseños de estudios más comunes en estudios epidemiológicos con un componente
genético: estudios de cohorte, estudio de casos y controles y estudios de corte
transversal. Validez causal de los diferentes tipos de estudios epidemiológicos. ; Estudios de casos y controles en epidemiología genética: diseño y análisis. Tablas de
análisis genético en un estudio de casos y controles. Modelos de regresión logística en
estudios de casos y controles. Ajuste por variables intervinientes.
; Concepto de asociación confundida
; Análisis estadístico clásico para controlar el efecto de variables de confusión en estudios
epidemiológicos. Estudios de casos y controles emparejados
; Efecto de confusión originado por la estratificación genética en la población. Enfoque de
evaluación de estructura poblacional
; Estudios de asociación con base familiar: Estudios de Tríos Caso-Progenitores. Estudio
de tríos caso-progenitores como variante de un estudio de caso-control emparejado. ; Análisis de estudios de tríos caso-progenitores: Test de Desequilibrio de Transmisión
(TDT). Cálculo del Riesgo Relativo Genotípico en estudios de tríos caso-progenitores.
Estudios de tríos caso-progenitores con múltiples marcadores genéticos. TDT como un
test de ligamiento o de desequilibrio de ligamiento. Extensiones de TDT en rasgos de
tipo cuantitativo.
Clase 7. Estudios de interacción genotipo-nutrición. Miércoles, 28 de noviembre (4
horas)
; Concepto de interacción genotipo-nutrición, genotipo-ambiente y genotipo-genotipo
desde el punto de vista epidemiológico
; Modelo multiplicativo de interacción: estudios de casos y controles. Modelo aditivo de
interacción: estudios de casos y controles
; Modelo multiplicativo de interacción: estudios de sólo-casos
; Modelo multiplicativo de interacción: estudios de tríos caso-progenitores
Clase 8. Miércoles, 5 de diciembre (4 horas)
; Presentaciones orales de alumnos
Sistema de Evaluación
La evaluación corresponde a la presentación oral de una revisión bibliográfica efectuada por los alumnos en torno a áreas específicas de epidemiología genética en enfermedades relacionadas con la nutrición. En esta revisión se pretende que los estudiantes realicen una búsqueda exhaustiva de las publicaciones en cada tema, destacando el aporte de los estudios epidemiológicos moleculares en el avance del estado del arte en cada área.
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